Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
WDR88Q6ZMY6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
WDR88Q6ZMY6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms