Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHLDB3Q6NSJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHLDB3Q6NSJ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHLDB3Q6NSJ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms