Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LYSMD4Q5XG99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LYSMD4Q5XG99 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms