Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAP47Q5SQN1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms