Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNI3KQ59H18 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI3KQ59H18 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms