Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROX2Q3B8N5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROX2Q3B8N5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROX2Q3B8N5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms