Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PCK2Q16822 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCK2Q16822 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCK2Q16822 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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