Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNCBQ16143 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNCBQ16143 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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