Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TAF1CQ15572 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF1CQ15572 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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