Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTAN1Q13813 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTAN1Q13813 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTAN1Q13813 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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