Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SHROOM2Q13796 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHROOM2Q13796 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHROOM2Q13796 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
SHROOM2Q13796 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
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