Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE4Q13068 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE4Q13068 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms