Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GTF3C1Q12789 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GTF3C1Q12789 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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GTF3C1Q12789 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF3C1Q12789 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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