Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 SMP1YBR182C 1359 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 ALT1YLR089C 1779 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 VMA13YPR036W 1437 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 GLO2YDR272W 825 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 CWC21YDR482C 408 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 CDC43YGL155W 1131 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 SET4YJL105W 1683 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 HPF1YOL155C 2904 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 MPC54YOR177C 1395 nt5.93□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 snR57snR57 88 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 LST8YNL006W 912 nt5.92□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 PDC1YLR044C 1692 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 YGL262WYGL262W 528 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 YGR066CYGR066C 879 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 SEC13YLR208W 894 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 PEX12YMR026C 1200 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 YNL143CYNL143C 393 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 UBC4YBR082C 447 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 YMD8YML038C 1329 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 RPT4YOR259C 1314 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 DED81YHR019C 1665 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 UBP7YIL156W 3216 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 MAL13YGR288W 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 CBP1YJL209W 1965 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 MND2YIR025W 1107 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 PSR1YLL010C 1284 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 SPS18YNL204C 903 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 ARR3YPR201W 1215 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP6Q12149 ERG7YHR072W 2196 nt5.9□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YIR007WYIR007W 2295 nt5.9□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 TUL1YKL034W 2277 nt5.9□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 FKH1YIL131C 1455 nt5.9□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 HRP1YOL123W 1605 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YDL172CYDL172C 480 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 CAD1YDR423C 1230 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 PAU17YLL025W 375 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SPC24YMR117C 642 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 PIN2YOR104W 849 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 OXP1YKL215C 3861 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SNT2YGL131C 4212 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SMF3YLR034C 1422 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 ABZ1YNR033W 2364 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 COX26YDR119W-A 201 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 EGD2YHR193C 525 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YPR195CYPR195C 330 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 OMS1YDR316W 1416 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 MET3YJR010W 1536 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SIS2YKR072C 1689 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YIL067CYIL067C 2037 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 VTC2YFL004W 2487 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 URA3YEL021W 804 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 VMA16YHR026W 642 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 GRE3YHR104W 984 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 snR3snR3 194 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 IBA57YJR122W 1494 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SSZ1YHR064C 1617 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 GEP3YOR205C 1671 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 GAS3YMR215W 1575 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YDL034WYDL034W 345 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 GCS1YDL226C 1059 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 LSM6YDR378C 261 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YDR445CYDR445C 408 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 PFA5YDR459C 1125 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 NQM1YGR043C 1002 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YHR214WYHR214W 612 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YAR066WYAR066W 612 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YPL073CYPL073C 486 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 ISA2YPR067W 558 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 snR34snR34 203 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 CST6YIL036W 1764 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 DBF2YGR092W 1719 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 MIF2YKL089W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YKR104WYKR104W 921 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 RPL3YOR063W 1164 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 CAR1YPL111W 1002 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 SIA1YOR137C 1869 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YDL183CYDL183C 963 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 PHM8YER037W 966 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YIL028WYIL028W 399 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YLR124WYLR124W 345 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 MFA2YNL145W 117 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 CPA1YOR303W 1236 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 OAZ1YPL052W 879 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 MNN2YBR015C 1794 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP6Q12149 YAP1801YHR161C 1914 nt5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms