Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 CKS1YBR135W 453 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 CNS1YBR155W 1158 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 HIS7YBR248C 1659 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 SAD1YFR005C 1347 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 WHI2YOR043W 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 RIT1YMR283C 1542 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 LAG2YOL025W 1983 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 HXT17YNR072W 1695 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YET3YDL072C 612 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MHR1YDR296W 681 nt6.4□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 ALB1YJL122W 528 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 TSA1YML028W 591 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YNL200CYNL200C 741 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 MRPL10YNL284C 969 nt6.4□□□□□ -1.38 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPL191CYPL191C 1083 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 GLN1YPR035W 1113 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 YPR142CYPR142C 564 nt6.4□□□□□ -1.38
PUF3Q07807 HST3YOR025W 1344 nt6.4□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 ECM18YDR125C 1362 nt6.4□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 IME2YJL106W 1938 nt6.4□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PGK1YCR012W 1251 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 NHP10YDL002C 612 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 GPM2YDL021W 936 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 UPS3YDR185C 540 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RPC25YKL144C 639 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 GMH1YKR030W 822 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 TOM40YMR203W 1164 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RUF22RUF22 515 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YOL163WYOL163W 510 nt6.39□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 CUP9YPL177C 921 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 ARA1YBR149W 1035 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 GUD1YDL238C 1470 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PYC2YBR218C 3543 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YHL017WYHL017W 1599 nt6.39□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 SLS1YLR139C 1932 nt6.38□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 COX9YDL067C 180 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MRS1YIR021W 1092 nt6.38□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 ICT1YLR099C 1185 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MRPS16YPL013C 366 nt6.38□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPR071WYPR071W 636 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 HXK2YGL253W 1461 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YBR284WYBR284W 2394 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PFK2YMR205C 2880 nt6.38□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 GPB2YAL056W 2643 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CEF1YMR213W 1773 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PAP1YKR002W 1707 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RCK1YGL158W 1539 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MTF2YDL044C 1323 nt6.37□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 RMD1YDL001W 1293 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YDR015CYDR015C 240 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YJL171CYJL171C 1191 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CAF40YNL288W 1122 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YPR147CYPR147C 915 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PEX32YBR168W 1242 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 SKI2YLR398C 3864 nt6.37□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 HXT2YMR011W 1626 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 ALT2YDR111C 1524 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 DSF1YEL070W 1509 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YNR073CYNR073C 1509 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YHR177WYHR177W 1362 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YDL016CYDL016C 303 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MNN10YDR245W 1182 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 IRC6YFR043C 714 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YGL185CYGL185C 1140 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 IMD1YAR073W 1212 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YLR463CYLR463C 552 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RNH201YNL072W 924 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MRPS12YNR036C 462 nt6.36□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 YOR342CYOR342C 960 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 TAF3YPL011C 1062 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RSA1YPL193W 1146 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 UBA3YPR066W 900 nt6.36□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 SCD6YPR129W 1050 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MNN5YJL186W 1761 nt6.36□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RSC2YLR357W 2670 nt6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 MAK11YKL021C 1407 nt6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 PRP24YMR268C 1335 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CDC34YDR054C 888 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PPM1YDR435C 987 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YEL068CYEL068C 333 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 PEX14YGL153W 1026 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CTR2YHR175W 570 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 RPI1YIL119C 1224 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CDC11YJR076C 1248 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 HMX1YLR205C 954 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 YPT6YLR262C 648 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MTF1YMR228W 1026 nt6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 USV1YPL230W 1176 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 ATP20YPR020W 348 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MDM31YHR194W 1740 nt6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 KKQ8YKL168C 2175 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 ICL1YER065C 1674 nt6.35□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 MSS116YDR194C 1995 nt6.35□□□□□ -1.39 RIP-Chip
PUF3Q07807 PDR18YNR070W 4002 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 VHS1YDR247W 1386 nt6.34□□□□□ -1.39
PUF3Q07807 CEG1YGL130W 1380 nt6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms