Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUD4Q01804 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD4Q01804 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms