Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFAMQ00059 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TFAMQ00059 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms