Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGD1P98174 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD1P98174 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD1P98174 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD1P98174 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGD1P98174 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD1P98174 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD1P98174 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD1P98174 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD1P98174 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGD1P98174 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGD1P98174 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGD1P98174 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGD1P98174 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD1P98174 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD1P98174 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD1P98174 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD1P98174 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGD1P98174 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGD1P98174 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms