Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH6P55285 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH6P55285 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH6P55285 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH6P55285 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH6P55285 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH6P55285 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH6P55285 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH6P55285 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH6P55285 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDH6P55285 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH6P55285 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH6P55285 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH6P55285 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH6P55285 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH6P55285 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH6P55285 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH6P55285 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms