Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN1CP49918 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN1CP49918 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms