Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRKCIP41743 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCIP41743 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKCIP41743 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms