Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VHLP40337 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VHLP40337 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VHLP40337 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VHLP40337 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VHLP40337 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VHLP40337 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VHLP40337 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VHLP40337 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VHLP40337 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VHLP40337 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VHLP40337 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VHLP40337 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VHLP40337 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VHLP40337 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VHLP40337 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VHLP40337 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms