Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ITGAEP38570 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ITGAEP38570 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ITGAEP38570 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ITGAEP38570 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms