Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	FAU1	YER183C	636 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	NIT2	YJL126W	924 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	SCW10	YMR305C	1170 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	ARG8	YOL140W	1272 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	MGR2	YPL098C	342 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	NHP6A	YPR052C	282 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	UGA1	YGR019W	1416 nt		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	MSS116	YDR194C	1995 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	BNA5	YLR231C	1362 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	THP1	YOL072W	1368 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YER187W	YER187W	426 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YNG2	YHR090C	849 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	RPL3	YOR063W	1164 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	STE13	YOR219C	2796 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	PAP1	YKR002W	1707 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	FUI1	YBL042C	1920 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	HXT14	YNL318C	1623 nt		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	FAA4	YMR246W	2085 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	SUB2	YDL084W	1341 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	YJL220W	YJL220W	453 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	DCI1	YOR180C	816 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	JJJ3	YJR097W	519 nt		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	PCS60	YBR222C	1632 nt		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	P38316	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	ARO10	YDR380W	1908 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	CPA1	YOR303W	1236 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	AIM17	YHL021C	1398 nt		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	YNL247W	YNL247W	2304 nt		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	AAD4	YDL243C	990 nt		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	TRP1	YDR007W	675 nt		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	APM2	YHL019C	1818 nt		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		5	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	MRPL39	YML009C	213 nt		5	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	MET31	YPL038W	534 nt		5	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	COX11	YPL132W	903 nt		5	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	PSY4	YBL046W	1326 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	DUG1	YFR044C	1446 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	STE7	YDL159W	1548 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	PRM1	YNL279W	1986 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	MHF2	YDL160C-A	243 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	TRS23	YDR246W	660 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	SOH1	YGL127C	384 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	CUE5	YOR042W	1236 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	OAZ1	YPL052W	879 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	UTP9	YHR196W	1728 nt		4.99	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	DPB2	YPR175W	2070 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	RPL28	YGL103W	450 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	RPP0	YLR340W	939 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	SFT2	YBL102W	648 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	CWC27	YPL064C	906 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	MRP51	YPL118W	1035 nt		4.98	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	CST6	YIL036W	1764 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	SLC1	YDL052C	912 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	SCS2	YER120W	735 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	THI5	YFL058W	1023 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	YMR245W	YMR245W	621 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	THI12	YNL332W	1023 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	TRM10	YOL093W	882 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	ADE3	YGR204W	2841 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	P38316	SET5	YHR207C	1581 nt		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	NOP16	YER002W	696 nt		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	AIM10	YER087W	1731 nt		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	RRN3	YKL125W	1884 nt		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	ELP2	YGR200C	2367 nt		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YIF1	YNL263C	945 nt		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	PAL1	YDR348C	1500 nt		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	ATM1	YMR301C	2073 nt		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YAP1802	YGR241C	1707 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	DBF4	YDR052C	2115 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	MKC7	YDR144C	1791 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	RIM15	YFL033C	5313 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YJL211C	YJL211C	444 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	GEP5	YLR091W	882 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	REC114	YMR133W	1287 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	TLG2	YOL018C	1194 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	ECM7	YLR443W	1347 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	UGA2	YBR006W	1494 nt		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YMR111C	YMR111C	1389 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	IPK1	YDR315C	846 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YJU2	YKL095W	837 nt		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	P38316	YKR073C	YKR073C	321 nt		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 128.8 ms