Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RXRAP19793 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRAP19793 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRAP19793 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRAP19793 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RXRAP19793 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRAP19793 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRAP19793 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRAP19793 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RXRAP19793 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RXRAP19793 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RXRAP19793 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RXRAP19793 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RXRAP19793 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRAP19793 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRAP19793 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRAP19793 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRAP19793 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RXRAP19793 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRAP19793 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRAP19793 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRAP19793 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RXRAP19793 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRAP19793 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRAP19793 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRAP19793 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRAP19793 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RXRAP19793 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RXRAP19793 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RXRAP19793 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RXRAP19793 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RXRAP19793 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RXRAP19793 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RXRAP19793 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms