Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFXP16104 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2AFXP16104 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2AFXP16104 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms