Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNAP12004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCNAP12004 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCNAP12004 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCNAP12004 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCNAP12004 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCNAP12004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCNAP12004 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCNAP12004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNAP12004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNAP12004 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCNAP12004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCNAP12004 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCNAP12004 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCNAP12004 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCNAP12004 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms