Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CAPNS1P04632 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1P04632 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPNS1P04632 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms