Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRNPP04156 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRNPP04156 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRNPP04156 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRNPP04156 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRNPP04156 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRNPP04156 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRNPP04156 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRNPP04156 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRNPP04156 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRNPP04156 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRNPP04156 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRNPP04156 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRNPP04156 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRNPP04156 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRNPP04156 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRNPP04156 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms