Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCNT3O95395 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCNT3O95395 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms