Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STX11O75558 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STX11O75558 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STX11O75558 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STX11O75558 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STX11O75558 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STX11O75558 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STX11O75558 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX11O75558 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX11O75558 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX11O75558 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX11O75558 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STX11O75558 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STX11O75558 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STX11O75558 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STX11O75558 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms