Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD6O43541 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD6O43541 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms