Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
J3KR12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
J3KR12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
J3KR12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3KR12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
J3KR12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
J3KR12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
J3KR12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
J3KR12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
J3KR12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3KR12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
J3KR12 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
J3KR12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
J3KR12 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
J3KR12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
J3KR12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms