Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UTP11Q9Y3A2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UTP11Q9Y3A2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UTP11Q9Y3A2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms