Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2IRD1Q9UHL9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD1Q9UHL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms