Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CGGBP1Q9UFW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CGGBP1Q9UFW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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