Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDP1Q9P0J1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDP1Q9P0J1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms