Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMC4Q9NTJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMC4Q9NTJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMC4Q9NTJ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms