Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDCBP2Q9H190 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDCBP2Q9H190 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms