Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GFRA4Q9GZZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GFRA4Q9GZZ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms