Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM39BQ9GZU3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM39BQ9GZU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM39BQ9GZU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms