Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PAAF1Q9BRP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PAAF1Q9BRP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAAF1Q9BRP4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249 ms