Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3CQ99985 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3CQ99985 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3CQ99985 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3CQ99985 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms