Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CITED2Q99967 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED2Q99967 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED2Q99967 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms