Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF12Q96QT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF12Q96QT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHF12Q96QT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms