Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PGBD1Q96JS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGBD1Q96JS3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PGBD1Q96JS3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms