Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM5Q96HC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM5Q96HC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDLIM5Q96HC4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms