Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHKBQ93100 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHKBQ93100 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHKBQ93100 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms