Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2CD4AQ8NCU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2CD4AQ8NCU7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2CD4AQ8NCU7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2CD4AQ8NCU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms