Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNAAF3Q8N9W5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAAF3Q8N9W5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms